为什么R中的order()在传递子集数据帧时生成NAs?

在理解这里发生的事情时有点困难,在我看来,对下面的数据帧进行排序的两种方法是等效的。

我们的数据帧,

cols <- c("chr","id","value")
df <-   data.frame(c(1:5),c("ENSG1","ENSG2","ENSG3","ENSG4","ENSG5"),runif(5,5.0,10.0))
names(df) <- cols
df <- df[sample(nrow(df)),]
df

chr    id    value
5      ENSG5 8.913645
2      ENSG2 6.117744
4      ENSG4 8.558403
3      ENSG3 9.625546
1      ENSG1 6.105577

df[order(df[,c("chr","id")]),]

chr    id    value
1      ENSG1 6.105577
2      ENSG2 6.117744
3      ENSG3 9.625546
4      ENSG4 8.558403
5      ENSG5 8.913645
NA    <NA>       NA
NA    <NA>       NA
NA    <NA>       NA
NA    <NA>       NA
NA    <NA>       NA

order() 如中所示,

df[order(df$chr,df$id),]

chr    id    value
1      ENSG1 6.105577
2      ENSG2 6.117744
3      ENSG3 9.625546
4      ENSG4 8.558403
5      ENSG5 8.913645

或者没有。