我正在处理一个大型医疗保险数据集,我对具有某些索赔代码的参与者感兴趣。我的一个纳入标准是,参与者必须在索赔日期前一年和之后一年投保。例如,如果他们在2017年9月27日受伤,他们需要从2016年9月27日到2018年9月27日的保险。
我试过做一个简单的行和,并使用apply,但都有相同的问题:
in from:to : numerical expression has # elements: only the first used
. 现在,我将范围保存为数据帧中的变量。它认为我理解为什么我会有这个问题——它期望一个数字并接收一个向量。如何让它有条件地选择要求和的列。我将在下面包括我的代码。
在我的例子中,我只是试图计算一个参与者在事故前后6个月的投保月数。这个
ins_#_#
变量是一个简单的是/否,表示参与者当月是否投保。感谢您的指导!
library(tidyverse)
set.seed(1)
df <- data.frame(id= seq(1,100),
injury_date = sample(seq(as.Date('2017/01/01'), as.Date('2017/12/31'), by="day"), 100),
ins_07_16 = sample(c(0,1), replace = TRUE),
ins_08_16 = sample(c(0,1), replace = TRUE),
ins_09_16 = sample(c(0,1), replace = TRUE),
ins_10_16 = sample(c(0,1), replace = TRUE),
ins_11_16 = sample(c(0,1), replace = TRUE),
ins_12_16 = sample(c(0,1), replace = TRUE),
ins_01_17 = sample(c(0,1), replace = TRUE),
ins_02_17 = sample(c(0,1), replace = TRUE),
ins_03_17 = sample(c(0,1), replace = TRUE),
ins_04_17 = sample(c(0,1), replace = TRUE),
ins_05_17 = sample(c(0,1), replace = TRUE),
ins_06_17 = sample(c(0,1), replace = TRUE),
ins_07_17 = sample(c(0,1), replace = TRUE),
ins_08_17 = sample(c(0,1), replace = TRUE),
ins_09_17 = sample(c(0,1), replace = TRUE),
ins_10_17 = sample(c(0,1), replace = TRUE),
ins_11_17 = sample(c(0,1), replace = TRUE),
ins_12_17 = sample(c(0,1), replace = TRUE),
ins_01_18 = sample(c(0,1), replace = TRUE),
ins_02_18 = sample(c(0,1), replace = TRUE),
ins_03_18 = sample(c(0,1), replace = TRUE),
ins_04_18 = sample(c(0,1), replace = TRUE),
ins_05_18 = sample(c(0,1), replace = TRUE),
ins_06_18 = sample(c(0,1), replace = TRUE))
df <- df %>%
mutate(month = as.numeric(format(as.Date(injury_date), "%m")), #pulling month of injury
low_mo = month + 2,
high_mo = month + 14)
df$insured <- rowSums(df[df$low_mo:df$high_mo]) #only uses first element
df$insured <- apply(df[df$low_mo:df$high_mo], 1, sum) #only uses first element
编辑:
虽然我没有明确指出我想要一个快速的解决方案,但我正在处理大量的数据,所以我测试了@akrun的哪个解决方案是最快的。我更改了数据帧,使其为1e5(100000)行。结果如下,以防有人好奇。
microbenchmark(o1 <- sapply(seq_len(nrow(df)), function(i) sum(df[i, df$low_mo[i]:df$high_mo[i]])),
o2 <- {colInd <- Map(`:`, df$low_mo, df$high_mo);
rowInd <- rep(seq_len(nrow(df)), lengths(colInd));
as.vector(tapply(df[-(1:2)][cbind(rowInd, unlist(colInd)-2)],
rowInd, FUN = sum))},
o3 <- {colInd1 <- Map(function(x, y) which(!seq_along(df) %in% x:y), df$low_mo, df$high_mo);
rowInd1 <- rep(seq_len(nrow(df)), lengths(colInd1));
rowSums(replace(df, cbind(rowInd1, unlist(colInd1)), NA)[-(1:2)], na.rm = TRUE)},
times = 5)
Unit: milliseconds
expr min lq mean median uq max neval
o1 20408.5072 20757.0285 20903.9386 20986.2275 21069.3163 21298.6137 5
o2 433.5463 436.3066 448.6448 455.6551 456.8836 460.8325 5
o3 470.6834 482.4449 492.9594 485.6210 504.1353 521.9122 5
> identical(o1, o2)
[1] TRUE
> identical(o2, o3)
[1] TRUE