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在gz文件中打开netcdfs数据

netcdf4 netcdf python

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Oalvinegro · 技术社区 · 2 年前

我已将netcdfs保存在 gz file 我正试图在python上作为地理数据框架导入。我不知道netcdfs中变量的名称。

我的代码:


gzipped_file_path = 'Maize_1970_Yield_ver12b_BRA.nc.gz'


with gzip.open(gzipped_file_path, 'rb') as f:
    # Read the content of the gzipped file
    content = f.read()

这部分工作得很好,但在尝试创建数据集时,我正在尝试:

df=nc.Dataset(content)

它开始永远运行(截至目前已经运行了3个多小时)。这个代码出了什么问题?

1 回复 | 直到 2 年前

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Dimitar 2 年前

好吧,所以 nc.Database 函数希望为打开的文件获取文件名或文件ID。

因此,首先,让我们准备好打开文件:

import gzip, os
import netCDF4 as nc

gzipped_file_path = 'Maize_1970_Yield_ver12b_BRA.nc.gz'
temp_nc_path = 'temp_netcdf_file.nc'

with gzip.open(gzipped_file_path, 'rb') as f_in, open(temp_nc_path, 'wb') as f_out:
    f_out.write(f_in.read())

现在 f_out 是一个打开的文件,基本上包含 f_in ,您可以使用 nc数据库 功能:

ds = nc.Dataset(temp_nc_path)
print(ds.variables.keys()) # check the keys

最后,关闭文件并删除临时文件,以避免系统中的垃圾和必须对 tmp 稍后的文件夹:

ds.close()
os.remove(temp_nc_path)

这样就可以了。