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在深度学习中使用nifti文件的合适方法是什么?

nibabel spm nifti deep-learning python

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umitkilic · 技术社区 · 6 年前

我通过深入的学习来处理医学图像的使用。有几种文件格式,如nifti、dicom、analyze、mnic等,我使用nifti脑mri文件进行深度学习实验。我已经在网上冲浪了几个星期,想知道如何正确地使用深度学习中的文件作为输入。结果,我很困惑。

1) 与其他类型一样,nifti在文件中有片段。一般来说,文章中选择的是切片的中间部分。这是标准吗?

2) 我使用nibabel库来读取python中的.nii文件。我应该把nii文件转换成jpeg或png还是应该将文件转换成numpy数组?还有,什么是好的和容易的方法(库,软件)将他们转换成jpeg或png?

请给出一些想法,因为文章既有利于理论信息,也不足以用于实践。

谢谢你的建议。

1 回复 | 直到 6 年前

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Mihai Andrei 6 年前

大多数图像处理库都需要numpy数组。转换成另一种像jpeg这样的磁盘格式是很奇怪的。

看起来你有一个体积数据集。根据要提取的特征,您将选择将该三维空间投影到二维中,或者您可能希望从信号中提取三维特征。