合并Rstudio中格式不同的文件

您应该首先考虑为什么要合并这些文件。从我所看到的情况来看,最好将文件分开保存,因为在第一个文件中,您记录的是两个阶段的通用指标(标题相同),而在第二个文件中,您记录的是两个阶段的不同指标(标题不同)。

由于第二个文件包含两个阶段的不同标题,因此无法将其转换为第一个文件的类似形式。但是,可以将第一个文件转换为第二个文件的格式,从而允许您合并这两个文件。然而,我强烈警告您不要这样做,因为这可能会妨碍您以这种方式快速分析数据。

library(ggplot2)
dat <- read.csv("file1.csv")
# This plots a boxplot comparing the evenness of the 2 phases
ggplot(dat, aes(x = as.factor(period), y = evenness)) + geom_boxplot()

但是,如果您坚持,下面是将file1重新格式化为每个条目的单行以与file2组合的代码

# One more warning, depending on how you 
# want to eventually wrangle your data, 
# doing this might make your life more difficult

library(dplyr)
f1 <- read.csv("file1.csv", stringAsFactors = FALSE)
dat1 <- dat[f1$phase == "incubating",]
dat2 <- dat[f1$phase == "chickrearing",]
dat2$phase <- dat1$phase <- NULL
names(dat1) <- c("bird.year", paste0("incubating.", names(dat1)[2:length(names(dat1))]))
names(dat2) <- c("bird.year", paste0("chickrearing.", names(dat2)[2:length(names(dat2))]))

f1.combined <- merge(dat1, dat2, by = "bird.year")

f2 <- read.csv("file2.csv")
f2 <- mutate(f2, bird.year = paste(Individual, year))

combined.files <- merge(f1.combined, f2, by = "bird.year")