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名称空间被覆盖的模块中的monkeypatch函数

monkeypatching biopython pytest mocking python

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ipetrik · 技术社区 · 6 年前

我试图在我使用的外部模块中对函数进行monkeypatch,但是monkeypatch似乎无法访问该函数,因为导入时该模块的命名空间被覆盖。

具体来说,我使用 Bio.PDB.PDBList.PDBList biopython 模块),我正在尝试修补 _urlretrieve 在里面 Bio.PDB.PDBList PDBList 这将是实质上更多的工作。但当我尝试中堂时:

m.setattr("Bio.PDB.PDBList._urlretrieve", mock_retrieve)

pytest抱怨:

AttributeError: 'type' object at Bio.PDB.PDBList has no attribute '_urlretrieve'

关于进一步检查 Bio.PDB .PDBList 似乎被全班覆盖了 .PDBList.PDBList :

# Download from the PDB
from .PDBList import PDBList

生物.PDB.PDBList 作为一个 type _URL检索 . 我的问题是,有没有办法让monkeypatch修补这个“隐藏”功能?

PDB列表 班级:

from Bio.PDB.PDBList import PDBList

_pdblist = PDBList()

downloaded_file = _pdblist.retrieve_pdb_file('2O8B', pdir='./temp', file_format='pdb')

1 回复 | 直到 6 年前

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hoefling 6 年前

PDBList 类与模块具有相同的名称 Bio.PDB.PDBList ,之后 import Bio.PDB.PDBList

import sys
from unittest.mock import Mock
import Bio.PDB.PDBList

def test_spam(monkeypatch):
    assert isinstance(Bio.PDB.PDBList, type)
    with monkeypatch.context() as m:
        m.setattr(sys.modules['Bio.PDB.PDBList'], '_urlretrieve', Mock())
        ...

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