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以文件名作为第一列连接多个txt文件

txt cat bash

user3224522 · 技术社区 · 3 年前

我想连接多个。txt文件在单个文件中,并将文件名作为每个文件前的第一列(以便了解数据来自哪个文件)。下面我使用的代码可以做到这一点,但只适用于第一行。

for i in *.txt; do echo -n "$i," && cat "$i"; done > tmpfile; mv tmpfile all-files.txt;

例如,输出如下:

filename1.txt,COVERAGE SUMMARY,,Aligned bases in genome,80754336928,100.00
filename1.txt,COVERAGE SUMMARY,,Average alignment coverage over genome,26.55
filename2.txt,COVERAGE SUMMARY,,Aligned bases in genome,88896465740,100.00
filename2.txt,COVERAGE SUMMARY,,Average alignment coverage over genome,33.40

1 回复 | 直到 3 年前

Dudi Boy 3 年前

建议 gawk 命令:

打印文件名,后跟 , 在每个文件的第一行中。

gawk 'BEGINFILE{printf("%s,",FILENAME)}1' *.txt

打印文件名,后跟 , 在每个文件的每一行中。

awk '{print FILENAME "," $0}' *.txt

leu 3 年前

我建议使用awk:

for f in *.txt; do awk "{print \"$f, \" \$0}" "$f"; done

RARE Kpop Manifesto 3 年前

3种不同的变体,以及 sub() 是不是快了一点:

代码

{m,g} 'sub("^",FILENAME",")' FS='^$' *.txt

基准测试

 ( time ( mawk2  '$NF=FILENAME","$NF' FS='^$' "${m3t}" )  | pvE9 >/dev/null)

 out9: 2.34GiB 0:00:02 [ 896MiB/s] [ 896MiB/s] [ <=> ]

 2.33s user 0.34s system 99% cpu 2.685 total

âââââââ

 ( time ( mawk2  '$!_=FILENAME","$!_' FS='^$' "${m3t}" )  | pvE9 >/dev/null) | lgp3 

 out9: 2.34GiB 0:00:02 [ 876MiB/s] [ 876MiB/s] [<=> ]

 2.38s user 0.34s system 99% cpu 2.744 total

âââââââ

( time ( mawk2  'sub("^",FILENAME",")' FS='^$' "${m3t}" )  | pvE9 >/dev/null) | lgp3 
 
 out9: 2.34GiB 0:00:02 [ 987MiB/s] [ 987MiB/s] [ <=> ]

 2.10s user 0.32s system 99% cpu 2.441 total

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