仅在输出中使用Snakemake通配符

有 dynamic keyword 。它可以这样使用:

rule all:
    input:
        dynamic('{id}.png')


rule draw:
    input:
        '{id}.txt'
    output:
        '{id}.png'
    shell:
        'cp {input} {output}'


rule cluster:
    input:
        'input.csv'
    output:
        dynamic('{id}.txt')
    shell:
        'touch 1.txt 2.txt'

您是否尝试设置通配符?例如,如果要对文件1到22迭代规则,可以在snakemake文件的顶部设置通配符:

num=range(1,23)

然后在snakemake文件名中使用该通配符或在{wildcard.num}中引用它