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删除模式sed之间的逗号

sed unix

Geomicro · 技术社区 · 2 年前

我正在尝试使用sed将文本文件中的所有逗号替换为“;”和“[”之间的空格。示例行为: K01810,GPI,,pgi;,glucose-6-phosphate,isomerase,[EC:5.3.1.9] 我的理想输出在哪里 K01810,GPI,,pgi; glucose-6-phosphate isomerase [EC:5.3.1.9] 。

我试过了 sed 's/;\(.*\)\[/;\1[/g' myfile.txt > newfile 但这并没有改变任何事情。sed非常令人困惑,我非常感谢您的帮助!

myfile.txt:

09100,Metabolism
09101,Carbohydrate,metabolism
00010,Glycolysis,/,Gluconeogenesis,[PATH:ko00010]
K00844,HK;,hexokinase,[EC:2.7.1.1]
K12407,GCK;,glucokinase,[EC:2.7.1.2]
K00845,glk;,glucokinase,[EC:2.7.1.2]
K25026,glk;,glucokinase,[EC:2.7.1.2]
K01810,GPI,,pgi;,glucose-6-phosphate,isomerase,[EC:5.3.1.9]
K06859,pgi1;,glucose-6-phosphate,isomerase,,archaeal,[EC:5.3.1.9]
K13810,tal-pgi;,transaldolase,/,glucose-6-phosphate,isomerase,[EC:2.2.1.2,5.3.1.9]
K15916,pgi-pmi;,glucose/mannose-6-phosphate,isomerase,[EC:5.3.1.9,5.3.1.8]
K24182,PFK9;,6-phosphofructokinase,[EC:2.7.1.11]
K00850,pfkA,,PFK;,6-phosphofructokinase,1,[EC:2.7.1.11]
K16370,pfkB;,6-phosphofructokinase,2,[EC:2.7.1.11]

1 回复 | 直到 2 年前

jhnc 2 年前

sed '
    # skip lines that do not match
    /^\(.*\)\(;.*\[\)\(.*\)$/ ! b

    # save a copy of original line
    h

    # extract prefix/suffix
    s//\1\n\3/

    # save them, restore original line
    x

    # extract part to change
    s//\2/

    # do the substitution
    y/,/ /

    # append prefix/suffix
    G

    # rearrange
    s/^\([^\n]*\)\n\([^\n]*\)\n/\2\1/
    
' myfile.txt >newfile

potong 2 年前

这可能适用于您(GNU sed):

sed -E ':a;s/(;[^,[]*),/\1 /;ta' file

匹配以 ; 并且不包含 [ 或 , ,然后是 , 并更换 , 带有空格。

如果替换成功,则重复此操作直到失败。

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