执行一系列R脚本的最佳实践是什么

如果您的脚本需要共享对象,我只需创建一个脚本,其中的功能已被分割为多个函数。结构可能有点像:

main_script.R
support_functions_A.R
support_functions_B.R

然后在 main_script.R 你使用 source 将函数加载到您的R会话中,例如。 source("support_functions_A.R") 这具有在一个地方具有主要功能的优点,具有更好的抽象级别。如果支持函数的数量增加,您也可以考虑为此创建一个R包。当您的代码也被其他人使用时,这一点尤其有用。

只有在不需要共享同一个R工作区的情况下,才能使用bash脚本按顺序调用脚本。我会避免像这样将R功能链接在一起,而是专注于编写函数而不是单独的脚本。

如果您需要在bash中运行一个R脚本作为脚本,您可以添加:

#! /usr/bin/env Rscript

在R脚本的顶部,使用 chmod .