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如何在biclust热图中显示行和列名?

heatmap r

Majid · 技术社区 · 7 年前

我已经用下面的代码在biclust包中绘制了热图,但是我找不到任何添加行和列名的选项。

library(biclust)
set.seed(1234)
data(BicatYeast)
resplaid <- biclust(BicatYeast, BCBimax(), verbose = FALSE)
heatmapBC(x = BicatYeast, bicResult = resplaid)

我怎么画呢?

1 回复 | 直到 7 年前

paoloeusebi 7 年前

这里有一个解决方案。查看heatmapBC函数,您会看到默认情况下轴设置为FALSE! 我使用了BicatYeast数据的一个子集版本,以使绘图更清晰

 library(biclust)
 set.seed(1234)
 data(BicatYeast)
 d <- as.matrix(BicatYeast)[1:30, 1:20]; d
 resplaid <- biclust(d, BCBimax())
 par(mar=c(10, 6, 2, 2) + 0.1)
 heatmapBC(x = d, bicResult = resplaid, axes = F, xlab = "", ylab = "")
 axis(1, at=1:dim(d)[2], labels = colnames(d), las=2)
 axis(2, at=1:dim(d)[1], labels = rownames(d), las=2)