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如何以其他名称安装R包?

installation r

BioGeek · 技术社区 · 8 年前

我在Red Hat Enterprise Linux 6上使用R3.4.1。我有3.0版本的软件包 asreml /tools/bioinfo/app/R-3.4.1/lib64/R/library .

> library(asreml)
Loading required package: lattice
Checking for license <redacted>

> .libPaths()
[1] "/tools/bioinfo/app/R-3.4.1/lib64/R/library"

asreml4 . 我已经下载了最新版本的*tar.gz文件,但是如果我下载了

R CMD INSTALL asreml_4.1.0.93.tar.gz

阿斯雷姆 文件夹,覆盖旧版本。那不是我想要的。

阿斯雷姆4 ,并将该文件夹复制到然后尝试加载,但加载了错误的版本:

> library(asreml, lib.loc="/tools/bioinfo/app/R-3.4.1/lib64/R/library/asreml4")
> packageVersion("asreml")
[1] â3.0.1â

那么,如何将其安装到这样我就可以用 library(asreml4) ?

1 回复 | 直到 8 年前

G. Grothendieck 8 年前

1) 编辑描述 下载源代码,编辑描述文件以使用不同的名称,然后构建并安装它。

2) 独立图书馆 或者,将新版本安装到单独的库中,然后使用其中一个来获得所需的版本:

library(asreml, lib = ...)
library(asreml)

.libPaths(new)

library(asreml)

然后再换回来。

实现库切换的一个简单方法是使用 dev_mode() 没有参数(来自devtools包)。第一次之后 开发模式() 命令发出时,默认库变成~/R-dev。此时,请使用普通的 install.packages lib= 它将被安装到~/R-dev中 library 开发模式() 再一次。 开发模式() 操纵默认库路径,以便可以使用 .libPaths()

library(devtools)
dev_mode() # ~/R-dev now default library
# ...
dev_mode() # restore usual default library

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