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如果指定的组不存在,是否可以使用Pytables来创建该组;如果存在,是否打开现有的组?

pytables hdf5 python

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Jason S · 技术社区 · 7 年前

PyTabes有一个 create_group 方法来创建组,但仅当组不存在时才有效。

我看不到 open_group 方法(属性访问方法除外,如 h5file.root.g1.g2 哪个可以进入这个小组 /g1/g2 );如果组不存在,是否有一种干净的创建组的方法,如果存在,是否返回现有组?

2 回复 | 直到 7 年前

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kcw78 7 年前

Jason,这是一个小代码片段,演示了 createparents 与…争论 create_table() 方法及 File.__contains__(path) 检查3个不同的组名并打印结果。

import tables as tb
import numpy as np
h5f = tb.open_file('SO_54080906.h5','w')

ds_dtype = np.dtype([('a',float),('b',float),('c',float)])
arr = np.array(np.arange(30.0).reshape(10,3))
recarr = np.core.records.array(arr,dtype=ds_dtype)

#create agroup at root level
h5f.create_group(h5f.root, 'agroup')

#create dataset 1 at root.bgroup level
dataset1 = h5f.create_table('/bgroup', 'dataset1',
                            createparents=True, obj=recarr )

for grpname in ['/agroup', '/bgroup' , '/cgroup']:
    if h5f.__contains__(grpname) :
      print ('found path for:', grpname)
    else:
      print ('path doesnt exist for:', grpname)

h5f.close()

输出如下:

found path for: /agroup
found path for: /bgroup
path doesnt exist for: /cgroup

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Jason S 7 年前

我最后用了 createparents 像这样做:

def createGroup(self, path):
    try:
        return self.hfile.get_node(path)
    except pt.NoSuchNodeError:
        parent, nodename = path.rsplit('/',1)
        if parent == '':
            parent = '/'
        return self.hfile.create_group(parent, nodename, createparents=True)