多个节点的SLURM作业脚本

我假设当你说job-A和job-B时,你指的是脚本中的两个echo。我还假设您显示的设置正在工作,但没有在适当的节点中启动作业并序列化执行(我感觉请求的资源不清楚,缺少信息,但如果SLURM没有抱怨,那么一切都正常)。在正确编写重定向输出时也应小心。如果第一个作业在第二个作业之后打开重定向,它将截断文件,您将丢失第二个作业输出。

#!/bin/bash
#SBATCH --job-name="test"
#SBATCH -D .
#SBATCH --output=./logs_%j.out
#SBATCH --error=./logs_%j.err
#SBATCH --nodelist=nodes[19,23]
#SBATCH --time=120:30:00
#SBATCH --partition=AWESOME
#SBATCH --wait-all-nodes=1

#launched on Node 1
srun --nodes=1 echo 'hello from node 1' > test.txt &

#Launched on Node2
srun --nodes=1 echo 'hello from node 2' >> test.txt &

这就是工作!文件./com_19.bash和./com_23.bash充当二进制文件。

#!/bin/bash
#SBATCH --job-name="test"
#SBATCH -D .
#SBATCH --output=./logs_%j.out
#SBATCH --error=./logs_%j.err
#SBATCH --nodelist=nodes[19,23]
#SBATCH --time=120:30:00
#SBATCH --partition=AWESOME
#SBATCH --wait-all-nodes=1
# Launch on node 1
srun -lN1 -n1 -r 1 ./com_19.bash &
# launch on node 2
srun -lN1 -r 0 ./com_23.bash &
sleep 1
squeue 
squeue -s 
wait