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R Travis CI错误:包已建议但不可用:ridge

r-package travis-ci r

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Steffen Moritz · 技术社区 · 7 年前

我正在为我的一个R包运行Travis CI。问题是生成失败,并出现一个错误,指出包的一个依赖项不可用(名为“ridge”的包)

* checking extension type ... Package
* this is package âimputeRâ version â2.1â
* checking package namespace information ... OK
* checking package dependencies ... ERROR
Package suggested but not available: âridgeâ
The suggested packages are required for a complete check.
Checking can be attempted without them by setting the environment
variable _R_CHECK_FORCE_SUGGESTS_ to a false value.
See section âThe DESCRIPTION fileâ in the âWriting R Extensionsâ
manual.
* DONE
Status: 1 ERROR
See
 â/home/travis/build/SteffenMoritz/imputeR/imputeR.Rcheck/00check.logâ
for details.
0.38schecking package dependencies ... ERROR
Package suggested but not available: âridgeâ

以下是Travis Build的链接: https://travis-ci.org/SteffenMoritz/imputeR/builds/436334069

Travis无法使用的程序包是当前在CRAN上的正常程序包。这是否与Gnu Scientific Library版本相关山脊需要1.14。。?我能解决这个问题吗?

2 回复 | 直到 7 年前

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Droplet 7 年前

你说得对,这是因为ridge需要一个外部库(Gnu-Scientific-library),travis默认情况下没有安装这个库。

Travis CI docs

在您的情况下,您需要添加

addons:
  apt:
    packages: libgsl0-dev

给你的 .travis.yml

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Steffen Moritz 7 年前

找到一个解决方案,至少让特拉维斯完成检查

您可以将其添加到Travis配置yaml文件:

env:
 global:
   - _R_CHECK_FORCE_SUGGESTS_: false

据我所知,缺点是:包括建议的软件包在内的所有东西都没有经过检查。因此,解决方案并不完全令人满意。