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插入符号序列功能-无法找到变量“optimismBoot”

r-caret parallel-processing r

cag · 技术社区 · 9 年前

我不熟悉R和RStudio,一直在尝试预测建模。以下训练函数在没有并行处理的情况下工作,但当我实现doSNOW makeCluster时,我得到了如下所示的与名为“optimismBoot”的变量相关的错误。我徒劳地搜索解决方案,尝试安装和卸载软件包,但都没有效果。敬请见谅。

 cl <- makeCluster(2, type = "SOCK")

 registerDoSNOW(cl)

 caret.cv <- train(ReturnedToMF ~ .,
                       data = trees.cetstrain,
                       method = "xgbTree",
                       tuneGrid = tune.grid,
                       trControl = cetstrain.control)
Error in e$fun(obj, substitute(ex), parent.frame(), e$data) : 
  unable to find variable "optimismBoot"

我在这个网站上找到了以下链接,但它并没有真正提供使并行处理工作的解决方案: Caret on R spills "unable to find variable "optimismBoot"" error message

3 回复 | 直到 8 年前

R.S. 9 年前

Caret github页面上有对该问题的引用。

请参见此处: https://github.com/topepo/caret/issues/706

在这种情况下,我想直接从github安装插入符号应该可以解决问题。

devtools::install_github('topepo/caret/pkg/caret')

https://github.com/topepo/caret

遵循以下步骤:(假设您使用的是RStudio)

devtools 照常包装
运行命令
重新启动RStudio/R。包资源管理器中的插入符号版本将与以前相同,但包将使用新代码
为了确保它已更新,您可以使用 caret:::nominalTrainWorkflow 并确保其中包含以下行: export <- c("optimism_xy") . 如果你现在就这么做的话 optimismBoot optimism_xy

PS: ~~插入符号的最新版本日期为2017年9月7日。因此,更新也应该解决这个问题。~~

Mohanad Mohammed 9 年前

here

我希望这有帮助

wordsforthewise 8 年前

我会说使用 example from the docs 用于并行处理。

library(parallel)
library(doMC)
# use all cores except one
doMC::registerDoMC(cores = parallel::detectCores() - 1)

这就是你要做的,然后你就可以跑了 train() 它应该使用您指定的内核数。 parallel

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