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如何避免使用基图过度绘制(点)?

points plot graphics r

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Henrik · 技术社区 · 15 年前

在讨论stats.stackoverflow之后,我正在完成一篇论文的图表,并决定(

然而,还有一个问题仍然存在,那就是图谋过度。例如,标记的点看起来像是反映了一个数据点,但实际上在该位置存在5个具有相同值的数据点。
因此,我想知道是否有一种方法可以处理 基础图中的过度绘图。 using points. as the function. 如果各个点变暗、变厚或……

手动操作不是一个选项(这样的图形和点太多)。此外, ggplot2 is also not what I want to learn to deal with this single problem(one reason is I treed to like dual axes what is not suppted in ggplot2 )。


   
    
     
      
       
        update:
        
         i written a function which automatically creates the above graphs and available overplotting by adding vertical or horizontal jitter(or both):
        
       
      
      
       
        
         check it out!
        
       
      
     
     
      
       
       
      
     
     
      
       
        此功能现在可用作
        
         raw.means.plot
        
        and
        
         raw.means.plot2
        
        in the
        
         
          plotrix
         
         >a>package(on cran)。
         
          after a discussion on stats.stackoverflow
         
        
        ,为了传输尽可能多的信息,创建以下图形,在前景和背景中显示原始数据:
        
       
      
     
     
     
     
      
       
        然而,还有一个问题仍然存在,那就是图谋过度。例如,标记的点看起来像是反映了一个数据点,但实际上在该位置存在5个具有相同值的数据点。
        

        
         因此,我想知道是否有办法处理过度策划
         
          base graph
         
         使用
         
          points
         
         作为功能。
        
        

        如果各个点变暗、变厚或……
       
       
        手动操作不是一个选项(这样的图形和点太多)。此外,
        
         ggplot2
        
        我也不想学着去处理这个单一的问题(一个原因是我喜欢双轴,这是不受支持的
        
         GGPROTT2
        
        )
       
       
       
        
         更新:
        
        我编写了一个函数,它自动创建上面的图形,并通过添加垂直或水平抖动(或两者)来避免过度绘制:
        
         check it out!
        
       
       
        此功能现在可用为
        
         raw.means.plot
        
        和
        
         raw.means.plot2
        
        在
        
         
          plotrix
         
        
        包装(在起重机上)。

4 回复 | 直到 13 年前

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Joris Meys 15 年前

标准的方法是在绘图前给数据添加一些噪声。r有一个函数jitter(),它正好做到了这一点。你可以用它把必要的噪声添加到你的坐标图中。如:

X <- rep(1:10,10)
Z <- as.factor(sample(letters[1:10],100,replace=T))

plot(jitter(as.numeric(Z),factor=0.2),X,xaxt="n")
axis(1,at=1:10,labels=levels(Z))

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Community Mohan Dere 9 年前

除了抖动之外,另一个好方法是阿尔法混合,您可以(在支持它的图形设备上)获得它作为第四个颜色参数。我提供了一个例子来“过度绘制”两个柱状图 this SO question .

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Greg Snow 15 年前

对于显示点数的一般问题,另一个想法是使用地毯图(地毯函数),这会沿着边缘放置小的勾号,以显示贡献的点数(仍然使用抖动或阿尔法混合表示领带)。这允许实际点显示其真实值而不是抖动值,但是地毯可以指示绘图的哪些部分具有更多值。

对于这个例子,直接抖动或阿尔法混合可能是最好的,但在其他一些情况下,地毯图可能是有用的。

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mbq 15 年前

您也可以使用 sunflowerplot 但是在这里很难实现。我会使用阿尔法混合,正如德克建议的。