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bash:在前缀后减去常量

bash

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Revan · 技术社区 · 7 年前

                     /locus_tag="PREFIX_05485"

包括开头的空白。不幸的是,第一个标识符不是以开头 00001 .

这行中唯一改变的部分是数字。

sed

                     /locus_tag="myNewPrefix_00001"

(下一项应为 ..."myNewPrefix_00002" 等等)。或者,条目也可以没有前导零。

据我所知,, 塞德 无法计算(如减去常量)。有没有办法解决这个问题?

编辑:有时相同的数字出现两次(例如,在修改过的文件中也应如此)

                     /locus_tag="PREFIX_12345"
                     /locus_tag="PREFIX_12345"
                     /locus_tag="PREFIX_12346"
                     /locus_tag="PREFIX_12347"

                     /locus_tag="myNewPrefix_00001"
                     /locus_tag="myNewPrefix_00001"
                     /locus_tag="myNewPrefix_00002"
                     /locus_tag="myNewPrefix_00003"

2 回复 | 直到 7 年前

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anubhava 7 年前

你可以用 awk

awk -v pf='myNewPrefix' 'BEGIN{FS=OFS="="}
$1 ~ /\/locus_tag$/ && split($2, a, /_/) == 2 {
   $2 = sprintf("\"%s_%05d\"", pf, (a[2] in seen ? i : ++i)); seen[a[2]]
} 1' file

                 /locus_tag="myNewPrefix_00001"
                 /locus_tag="myNewPrefix_00001"
                 /locus_tag="myNewPrefix_00002"
                 /locus_tag="myNewPrefix_00003"

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stack0114106 7 年前

检查这一行

/tmp> cat littlebird.txt
abcdef
                     /locus_tag="PREFIX_12345"
hello hai
                     /locus_tag="PREFIX_12345"
                     /locus_tag="PREFIX_12346"
                     /locus_tag="PREFIX_12347"
123 456
end
/tmp> perl -pe 'BEGIN{$r=qr/PREFIX_(.+)["]/} if(/$r/) {$kv{$1}++;$kv{$1}==1 and $kv2{$1}=sprintf("%04d",++$i) for(keys %kv) } s/$r/PREFIX_$kv2{$1}/g ' littlebird.txt
abcdef
                     /locus_tag="PREFIX_0001
hello hai
                     /locus_tag="PREFIX_0001
                     /locus_tag="PREFIX_0002
                     /locus_tag="PREFIX_0003
123 456
end
/tmp>