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R:lattice.qq我怎么做治疗[x]和对照的多面板图?

quantile lattice r

dnagirl · 技术社区 · 15 年前

我有这样一个数据帧:

str(Data)
'data.frame':   11520 obs. of  29 variables:
 $ groupname  : Factor w/ 8 levels "Control","Treatment1",..: 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 ...
 $ fCycle     : Factor w/ 2 levels "Dark","Light": 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 ...
 $ totdist    : num  0 67.5 89.8 109.1 58.3 ...
 #etc.

我可以做一个单一的治疗1与对照的对比图,如下所示:

qq(groupname~totdist|fCycle, data=Data, 
 subset=(groupname=='Control'|groupname=='Treatment1'))

alt text

我想自动绘制类似的图,治疗2和对照…治疗X和对照。这是循环的地方还是格子有更好的方法?

1 回复 | 直到 9 年前

nullglob 15 年前

library(lattice)
Data <- data.frame(groupname = factor(rep(c('Control',paste('Treatment',1:7,sep='')),each = 100)),
                   fCycle = factor(rep(rep(c('Dark','Light'),each = 50),8)),
                   totdist = sample(unlist(iris),800,replace = TRUE))

接下来,添加一个变量来区分治疗组和对照组(即。 "Treatment2" 重新编码为 "Treatment" 等)

Data$groupname2 <- factor(gsub('[1-9]','',as.character(Data$groupname)))

然后重新排列数据集,以便给每个治疗组一份对照数据

Data2 <- NULL
for(treat in paste('Treatment',1:7,sep='')){
  Data2 <- rbind(Data2,
                 cbind(rbind(Data[Data$groupname == treat,],Data[Data$groupname == 'Control',]),
                       treat))
}

qq(groupname2~totdist|fCycle*treat, data=Data2)

如果你希望每个治疗都有单独的图,那么一个循环会更好

pdf('treatVsContQq.pdf')
for(treat in paste('Treatment',1:7,sep='')){
  print(qq(groupname~totdist|fCycle, data=Data,
     subset=(groupname=='Control'|groupname==treat)))
}
dev.off()

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