无法在两台以上的计算机上运行OpenMPI

尝试运行中的第一个示例时, boost::mpi tutorial ,我无法跨越两台以上的机器。具体来说,这似乎很好:

mpirun -hostfile hostnames -np 4 boost1

主机名中的每个主机名为 <node_name> slots=2 max_slots=2 . 但是,当我将进程数增加到5时,它就挂起了。我减少了 slots / max_slots 当我超过两台机器时,结果相同。在节点上,这显示在作业列表中:

<user> Ss orted --daemonize -mca ess env -mca orte_ess_jobid 388497408 \
-mca orte_ess_vpid 2 -mca orte_ess_num_procs 3 -hnp-uri \
388497408.0;tcp://<node_ip>:48823

此外,当我杀死它时,我会收到以下信息:

node2- daemon did not report back when launched
node3- daemon did not report back when launched

集群是用 mpi 和 boost 在安装了NFS的驱动器上可以访问libs。我是否在使用NFS时陷入死锁?或者,还有别的事情吗?

更新: 明确地说,我正在运行的Boost程序是

#include <boost/mpi/environment.hpp>
#include <boost/mpi/communicator.hpp>
#include <iostream>
namespace mpi = boost::mpi;

int main(int argc, char* argv[]) 
{
  mpi::environment env(argc, argv);
  mpi::communicator world;
  std::cout << "I am process " << world.rank() << " of " << world.size()
        << "." << std::endl;
  return 0;
}

来自@dirk eddelbuettel's recommendations ,我编译并运行了MPI示例 hello_c.c ,如下

#include <stdio.h>
#include "mpi.h"

int main(int argc, char* argv[])
{
    int rank, size;

    MPI_Init(&argc, &argv);
    MPI_Comm_rank(MPI_COMM_WORLD, &rank);
    MPI_Comm_size(MPI_COMM_WORLD, &size);
    printf("Hello, world, I am %d of %d\n", rank, size);
    MPI_Barrier(MPI_COMM_WORLD);
    MPI_Finalize();

   return 0;
}

它在一台具有多个进程的机器上运行良好,这包括到任何节点的ssh和运行。每个计算节点都与通过NFS从远程计算机安装的工作目录和MPI/Boost目录相同。从文件服务器运行boost程序时(除了boost/mpi是本地节点外,与节点相同),我可以在两个远程节点上运行。但是,对于“hello world”,运行命令 mpirun -H node1,node2 -np 12 ./hello 我得到

[<node name>][[2771,1],<process #>] \
[btl_tcp_endpoint.c:638:mca_btl_tcp_endpoint_complete_connect] \
connect() to <node-ip> failed: No route to host (113)

当所有的“你好世界”都被打印出来并且挂在最后。但是,从远程节点上的计算节点运行时的行为不同。

“Hello World”和“Boost code”都能用 mpirun -H node1 -np 12 ./hello 从节点2运行时,反之亦然。(与上面的意义相同:orted在远程机器上运行,但不进行通信。)

这种行为不同于在文件服务器上运行的MPI-libs是本地的,而在计算节点上运行的这一事实表明,我可能遇到了一个NFS死锁。这是一个合理的结论吗?假设是这样,我如何配置MPI以允许我静态链接它?另外,我不知道如何处理从文件服务器运行时遇到的错误,有什么想法吗?