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重建自定义R包时,依赖项下列出的包未安装

r-library r

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matsuo_basho · 技术社区 · 6 年前

我正在重建一个定制的R包,其中在描述文件的dependens行中有RcppArmadillo。

我正在运行r3.5.1。在RStudio中重建包时,出现错误:

ERROR: dependency âRcppArmadilloâ is not available for package 'custom package name'

根据 R Packages book ,重新生成包时必须安装依赖/导入下的包。

1 回复 | 直到 6 年前

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duckmayr 6 年前

解决方案

使用 devtools::install() 相反。

解释

根据 RStudio website ,

Build and Reload命令按顺序执行几个步骤,以确保得到干净、正确的结果:
1.卸载包的任何现有版本(必要时包括共享库)。
2.使用R CMD INSTALL构建和安装包。
3.重新启动底层R会话,以确保重新加载包的环境干净。
4.通过执行库函数在新的R会话中重新加载包。

devtools::install() 将为您安装依赖项--从 help("install.packages") :

使用R CMD INSTALL安装包。威尔尝试安装来自CRAN的包的依赖项,如果它们还没有安装。

(强调补充)这不是 R CMD INSTALL 独自一人(见 ?INSTALL 从R或 R CMD INSTALL --help

所以,它似乎是一种语言

尚未存在,请安装到您的计算机上

从哈德利那里 R Packages 有点具体;它不适用于使用 R命令安装 (RStudio的build函数显然使用了这个函数),但确实适用于 . 这是个人品味的问题,但老实说,我强烈建议使用 devtools 在包开发工作流中。

例子

rbenchmark 从我的系统通过

remove.packages("rbenchmark")

然后创建一个虚拟包

devtools::create("SOexample", rstudio = FALSE)

本奇马克 在进口中 SOexample 看情况而定。我在中添加了以下代码 R/hello_world.R :

hello_world <- function() print("Hello, world!")

R命令安装 ,但出现了错误

*安装到library/home/duckmayr/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.5

*删除/home/duckmayr/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.5/soe示例

devtools::install() :

> devtools::install("SOexample/")
Installing SOexample
trying URL 'https://cloud.r-project.org/src/contrib/rbenchmark_1.0.0.tar.gz'
Content type 'application/x-gzip' length 5093 bytes
==================================================
downloaded 5093 bytes

Installing rbenchmark
'/usr/lib/R/bin/R' --no-site-file --no-environ --no-save --no-restore --quiet  \
  CMD INSTALL '/tmp/RtmpA0NOMe/devtools723832018149/rbenchmark'  \
  --library='/home/duckmayr/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.5' --install-tests 

* installing *source* package ârbenchmarkâ ...
** package ârbenchmarkâ successfully unpacked and MD5 sums checked
** R
** demo
** byte-compile and prepare package for lazy loading
** help
*** installing help indices
** building package indices
** testing if installed package can be loaded
* DONE (rbenchmark)
'/usr/lib/R/bin/R' --no-site-file --no-environ --no-save --no-restore --quiet  \
  CMD INSTALL '/home/duckmayr/SOexample'  \
  --library='/home/duckmayr/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.5' --install-tests 

* installing *source* package âSOexampleâ ...
** R
** byte-compile and prepare package for lazy loading
** help
No man pages found in package  âSOexampleâ 
*** installing help indices
** building package indices
** testing if installed package can be loaded
* DONE (SOexample)