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如何从C#中使用HDF5DotNet读取HDF5多维数组数据集。网

hdf5dotnet hdf5 .net c#

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Doug Null · 技术社区 · 7 年前

我需要读取一个包含3 x 3数组的HDF5数据集,数据类型是double。

从下面的代码返回时,我的Visual Studio 2017 Pro崩溃。

使用调试器,该代码从HDF5读取2-dim阵列;我可以在调试器中读取它;但函数read_double_数组返回调用方时崩溃。

示例中的第二次代码尝试 STACKO .

    public static double[,]  read_double_array( H5FileId fileId, string dataset_name, int dim1, int dim2 )
{
    double [,] return_data = new double[ dim1, dim2 ];
    try
    {
        H5Array<double> h5_array = new H5Array<double>( return_data );
        H5DataSetId double_array_dataset  = H5D.open( fileId, dataset_name );
        H5D.read<double>(   double_array_dataset, 
                            new H5DataTypeId(H5T.H5Type.NATIVE_DOUBLE), 
                            h5_array );
        H5D.close(double_array_dataset);

    }
    catch( HDFException e )
    {
        Console.WriteLine( e.Message );
        int aa=0;
    }
    return return_data;
}

我的代码第一次尝试失败了

public static double[,]  read_double_array( H5FileId fileId, string dataset_name, int dim1, int dim2 )
{
        double [,] return_data = new double[ dim1, dim2 ];
    try
    {
        H5DataSetId dataSetId  = H5D.open( fileId, dataset_name );
        H5D.read(   dataSetId, 
                    new H5DataTypeId( H5T.H5Type.NATIVE_DOUBLE ),
                    new H5Array<double>( return_data ) );
    }
    catch( HDFException e )
    {
        Console.WriteLine( e.Message );
        int aa=0;
    }
    return return_data;  <<<<<<<<<<<<<<<<<<   H A N G S   H E R E
}

2 回复 | 直到 7 年前

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Doug Null 7 年前

我成功了。这是我的密码。。。

    // Reads a 2-dim array of double.
// INPUT:  fileId of open HDF5 file
public static bool  read_double_array( H5FileId fileId, string dataset_name, int dim1, int dim2, ref double [,] output_double_array )
{

    try
    {
        output_double_array = new double[ dim1, dim2 ];
        H5Array<double> h5_array = new H5Array<double>( output_double_array );
        H5DataSetId dataset = H5D.open( fileId, dataset_name);
        H5D.read<double>(   dataset, 
                            new H5DataTypeId(H5T.H5Type.NATIVE_DOUBLE), 
                            h5_array);
    }
    catch( HDFException e )
    {
        Console.WriteLine( e.Message );
        return false;
    }
    return true;
}

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SOG 4 年前

让自己免于严重的痛苦(由于HDF5低级别的实现细节),然后离开 HDFql .

下面是一个在C#中使用HDFql读取名为 dset 在名为 test.h5 (假设文件和数据集都已存在):

// use HDFql namespace (make sure it can be found by the C# compiler)
using AS.HDFql;

public class Test
{
    public static void Main(string []args)
    {
        // declare variables
        double [,]data = new double[3, 3];
        int x;
        int y;

        // select (i.e. read) dataset "dset" from HDF5 file "test.h5" into variable "data"
        HDFql.Execute("SELECT FROM test.h5 dset INTO MEMORY " + HDFql.VariableTransientRegister(data));

        // display content of variable "data"
        for(x = 0; x < 3; x++)
        {
            for(y = 0; y < 3; y++)
            {
                System.Console.WriteLine(data[x, y]);
            }
        }
    }
}