MML
,JSim的数学建模语言,自JSim被研究人员广泛使用以来。基本上,模型包含变量(具有公式、初始值和可选单位)和常量参数(具有值和可选单元)。变量和参数在内部由相同的数据类型表示,因为两者之间的唯一区别是它是否有公式。
我目前的解决方案是将模型保存为XML,而不是MML文本文件:
<model xmlns="http://tempuri.org/model_schema.xsd">
<name>sample_model</name>
<description>String</description>
<variable type="realDomain" constant="false">
<name>ID_1</name>
<formula>G_p/VG</formula>
<value>0.75</value>
<units>s^-1</units>
<description>String</description>
<anatomical_structure FMAID="62970">
<name>Kidney</name>
</anatomical_structure>
</variable>
<variable type="real" constant="true">
<name>ID_2</name>
<formula />
<value>1000</value>
<units>mg</units>
</variable>
</model>
<xs:schema id="model_schema" targetNamespace="http://tempuri.org/model_schema.xsd" elementFormDefault="qualified" xmlns="http://tempuri.org/model_schema.xsd" xmlns:mstns="http://tempuri.org/model_schema.xsd" xmlns:xs="http://www.w3.org/2001/XMLSchema">
<xs:element name="model">
<xs:complexType>
<xs:sequence>
<xs:element name="name" type="xs:string" />
<xs:element name="description" type="xs:string" minOccurs="0" />
<xs:element name="variable" maxOccurs="unbounded">
<xs:complexType>
<xs:sequence>
<xs:element name="name" type="xs:ID" />
<xs:element name="formula" type="xs:string" />
<xs:element name="value" type="xs:float" />
<xs:element name="units" type="xs:string" minOccurs="0" />
<xs:element name="description" type="xs:string" minOccurs="0" />
<xs:element name="anatomical_structure" minOccurs="0">
<xs:complexType>
<xs:sequence>
<xs:element name="name" type="xs:string" />
</xs:sequence>
<xs:attribute name="FMAID" type="xs:int" use="required" />
</xs:complexType>
</xs:element>
</xs:sequence>
<xs:attribute name="constant" type="xs:boolean" use="required" />
<xs:attribute name="type" type="var_type" />
</xs:complexType>
</xs:element>
</xs:sequence>
</xs:complexType>
</xs:element>
<xs:simpleType name="var_type">
<xs:restriction base="xs:string">
<xs:enumeration value="realDomain" />
<xs:enumeration value="real" />
<xs:enumeration value="int" />
</xs:restriction>
</xs:simpleType>
</xs:schema>