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awk或sed删除字段中最后一位之后的文本

sed awk

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justaguy · 技术社区 · 8 年前

在 tab-delimited $1 . 我试过两次 sed 命令和接近,但不是期望的输出。我不知道我用的是不是最好的方法。谢谢:)。

文件

chr7:55249071C>T    EGFR
chr7:55242469_55242477delTTAAGAGAAG EGFR

期望输出

chr7:55249071   EGFR
chr7:55242469_55242477  EGFR

塞德

sed 's/[0-9]//g' file

chr:C>T EGFR
chr:_delTTAAGAGAAG  EGFR

sed 's/[a-z]//g' file

7:55249071C>T   EGFR
7:55242469_55242477TTAAGAGAAG   EGFR

3 回复 | 直到 8 年前

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Sundeep 8 年前

$ awk 'BEGIN{FS=OFS="\t"} {sub(/[^0-9]+$/, "", $1)} 1' ip.txt
chr7:55249071   EGFR
chr7:55242469_55242477  EGFR

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oguz ismail FCulig 8 年前

如果保证您的输入只有两个制表符分隔的字段,那么您可以使用:

sed 's/[^0-9]\+\t/\t/' file

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potong 8 年前

这可能适用于您(GNU-sed):

sed 's/\(.*[0-9]\)\S\+/\1/' file

匹配到最后一个数字并存储为反向引用,并删除其后的所有非空格字符。