KERA的输入组合:时间序列和功能

假设1

由于模棱两可,我假设是这样(如果不是,请评论,我会更改)

• 我打电话给ECG、HRV等。 功能 每一步都不同
• 频率最高的功能有15000个步骤,而其他功能的步骤较少
• 您有一个独立的功能,它不是连续的,没有步骤。(我称之为 单独的功能 在此答案中)

额外问题:

对插入频率较低的特征,并生成类似以下的输入张量:

• (numberOfSequences_maybePatient, 15000 steps, features_ECG_HRV_etc)

您需要保持功能之间的相关性 什么时候 它们会发生,这是通过同步这些步骤实现的。

零填充是否会影响结果?

是的,除非使用“掩蔽”(掩蔽层)。但这只对处理有意义 样品 (不同的序列或患者)具有不同的长度,而不是 功能 具有不同的长度/采样率。

例如,以下情况适用于零填充和掩蔽:

• 序列1:长度100(包括所有特征,ECG、HRV等)
• 序列2:长度200(包括所有特征,ECG、HRV等)

如何处理 separate feature ?

有许多可能的方法。最简单的方法之一,可能也是非常有效的方法,就是让它成为一个包含所有15000个步骤的恒定序列。这种方法不需要考虑特征与其余数据的关系,而是将任务留给模型

假设第一个序列的单独特征值为2,第二个序列的单独特征值为4,则生成此数据数组:

                          ECG, HRV, separate
--------------------------------------------------------
             |   [
sequence 1:  |      [
step 1       |            [ecg1, hrv1, 2],
step 2       |            [ecg2, hrv2, 2],
step 3       |            [ecg3, hrv3, 2]
             |      ]
             |
sequence 2:  |      [
step 1       |            [ecg4, hrv4, 4],
step 2       |            [ecg5, hrv5, 4],
step 3       |            [ecg6, hrv6, 4]
             |      ]
             |   ]

您还可以输入is作为模型中的附加输入:

regularSequences = Input((15000,features))
separateFeature = Input((1,)) #assuming 1 value per sequence    

然后决定是否要在某处求和、在某处相乘等。如果您知道此功能的含义以及它与其余数据的关系,以选择最佳操作和位置,则此方法可能比其他方法更有效。

假设2

从更新的答案中提取以下描述:

                     ECG,      HRV,   F1,   F2,  ...
-------------------------------------------------------------
Sequence 1 |
    Step 1 |     [[15000x1],[1000x1],[1x1],[1x1],...] 
    Step 2 |     [[15000x1],[1000x1],[1x1],[1x1],...] 
    Step 3 |     [[15000x1],[1000x1],[1x1],[1x1],...] 

Sequence 2 |
    Step 1 |     [[15000x1],[1000x1],[1x1],[1x1],...] 
    Step 2 |     [[15000x1],[1000x1],[1x1],[1x1],...] 
    Step 3 |     [[15000x1],[1000x1],[1x1],[1x1],...] 

然后:

• ECG中的单个时间步长有15000个功能。(您确定这不是15000个步骤的序列吗?)
• HRV中的一个时间步有1000个功能。(您确定这不是1000个步骤的序列吗?)
• 每个时间步有几个其他单独的功能。

好的,组织这些数据很容易(但请记住我上面提出的问题),只需在每个时间步骤中将所有功能打包在一起:

输入数据的形状为: (sequences, steps, 16002)

                     ECG,      HRV,   F1,   F2,  ...
-------------------------------------------------------------
              [
Sequence 1 |    [
    Step 1 |     [ecg1,ecg2,...,ecg15000,hrv1,hrv2,...hrv1000,F1,F2,...]
    Step 2 |     [ecg1,ecg2,...,ecg15000,hrv1,hrv2,...hrv1000,F1,F2,...]
    Step 3 |     [ecg1,ecg2,...,ecg15000,hrv1,hrv2,...hrv1000,F1,F2,...]
                ]
Sequence 2 |    [
    Step 1 |     [ecg1,ecg2,...,ecg15000,hrv1,hrv2,...hrv1000,F1,F2,...]
    Step 2 |     [ecg1,ecg2,...,ecg15000,hrv1,hrv2,...hrv1000,F1,F2,...]
    Step 3 |     [ecg1,ecg2,...,ecg15000,hrv1,hrv2,...hrv1000,F1,F2,...]
                ]