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如何安装RODBC,使其使用unixODBC?

unixodbc rodbc freetds r sql-server

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ejames · 技术社区 · 7 年前

在安装和配置FreeTDS和unixODBC并确认它们工作正常后,我正在尝试配置RODBC。然而,当我试图在R控制台中查看ODBC数据源时,我得到了以下结果。

> odbcDataSources()
named character(0)

如果我尝试使用FreeTDS驱动程序,我会得到以下结果。

>odbcDriverConnect("driver={FreeTDS};server=xx.xx.xx.xx;port=1433;database=XXXX_Analysis;trusted_connection=true;UID=********;PWD=********") :
[RODBC] ERROR: state IM003, code 0, message [iODBC][Driver Manager]Specified driver could not be loaded

基于错误,RODBC似乎正在尝试使用iODBC而不是unixODBC。我不知道如何配置RODBC以使用unixODBC。

3 回复 | 直到 7 年前

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Jim 5 年前

正确的方法是将odbc管理器指定给包的配置脚本,如下所示

install.packages("RODBC", 
 type = "source", 
 INSTALL_opts="--configure-args='--with-odbc-manager=odbc'"
)

--with-odbc-manager=odbc 表示要使用unixODBC
--with-odbc-manager=iodbc 表示要使用iODBC

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Nadir Sidi 7 年前

在Mac OS 10.13.3 High Sierra上配置unixODBC后,我也遇到了这个问题。我尝试配置我的。Renviron为ODBCINI设置了一个特定于R的环境变量,但RODBC仍然不会列出我的数据源名称(DSN)。此外,我无法找到ODBCinst中指定的驱动程序。尽管能够与isql连接,但ini甚至可以获得一个使用RODBC::ODBCDriverConnect()的连接字符串。

最终起作用的只是:

remove.packages('RODBC')
install.packages('RODBC', type="source")

如果您在mac上从源代码安装RODBC,它似乎会在odbc上启动。ini文件和odbcinst。ini文件正确。

感谢这篇帖子对解锁钥匙的微妙评论: http://eriqande.github.io/2014/12/19/setting-up-rodbc.html

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ejames 7 年前

结果是默认的RODBC包安装无法与unixODBC一起使用。下面是重新编译和安装RODBC的过程。

通过R控制台删除当前通用RODBC包。

>remove.packages("RODBC")
Removing package from â/Library/Frameworks/R.framework/Versions/3.4/Resources/libraryâ
(as âlibâ is unspecified)

下载RODBC的源代码。

https://cran.r-project.org/src/contrib/RODBC_1.3-15.tar.gz
将环境变量DYLD\u LIBRARY\u PATH设置为unixODBC库所在的位置。我使用自制软件安装unixODBC,因此我的库位于/usr/local/lib。

export DYLD_LIBRARY_PATH=/usr/local/lib
现在重新安装RODB,使其拾取新的库位置。

R CMD INSTALL /Users/xxxxxx/Downloads/RODBC_1.3-15.tar.gz

有相当多的输出,但看看最后,你应该会看到这样的东西。

clang -dynamiclib -Wl,-headerpad_max_install_names -undefined dynamic_lookup -single_module -multiply_defined suppress -L/Library/Frameworks/R.framework/Resources/lib -L/usr/local/lib -o RODBC.so RODBC.o -lodbc -F/Library/Frameworks/R.framework/.. -framework R -Wl,-framework -Wl,CoreFoundation
    installing to /Library/Frameworks/R.framework/Versions/3.4/Resources/library/RODBC/libs
    ** R
    ** inst
    ** preparing package for lazy loading
    ** help
    *** installing help indices
    ** building package indices
    ** installing vignettes
    ** testing if installed package can be loaded
    * DONE (RODBC)

注意 -L/usr/local/lib 表示已提取库位置。

现在,您应该能够看到unixODBC提供的ODBC连接。在重新启动的R控制台中,您可以键入以下内容来验证RODBC正在使用unixODBC。

> library("RODBC")
> odbcDataSources()
      MYMSSQL1        MYMSSQL XXXXXXXXX_C_DB  XXXXXXXX-SQL1 
     "FreeTDS"      "FreeTDS"      "FreeTDS"      "FreeTDS"

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